Лучшим решением будет ЭДО, так как у партнеров в распоряжении будет один общий документ. После того как обе стороны его подпишут, сведения автоматически уйдут в Честный ЗНАК.
1) Подключить систему электронного документооборота.

Это могут быть сведения из учетной системы или данные, считанные непосредственно с товара перед отгрузкой. Последнее решение удобнее: не нужно хранить коды в своей учетной системе (а их будет немало, и придется озадачиться увеличением серверных мощностей), можно убедиться, что коды, которые поедут к получателю, действительно попали в УПД и были переданы в Честный ЗНАК и списаны с вас.
1) Оснастить склад оборудованием для считывания кодов DataMatrix (это могут быть и 2D-сканеры, ТСД). Проверить 2D-сканер на сайте СКБ Контур.
2) Установить программное обеспечение, которое формирует УПД с кодами маркировки.

Такая проверка кодов перед отгрузкой снизит риск того, что при приемке покупатель обнаружит неверные коды и вернет качественный товар обратно.
1) Оснастить склад оборудованием для считывания кодов DataMatrix (это могут быть и 2D-сканеры, ТСД).
2) Установить на складе программное обеспечение, который сможет сверить коды, считанные с товара, с данными в Честный ЗНАК.

Если вы отгружаете товар в агрегированных или транспортных упаковках, то можете сформировать и нанести на упаковки коды-агрегаты. При формировании такого кода, в системе Честный ЗНАК указывается, какие коды товара в нем содержатся.
1) Сформировать код-агрегат и зарегистрировать его и его содержимое в системе Честный ЗНАК.