Здесь лучшим решение будет ЭДО, так у вас и ваших контрагентов в распоряжении будет один общий документ. После того как обе стороны его подпишут, система ЭДО автоматически передаст данные в систему Честный ЗНАК. ЭДО также может быть встроено в вашу товароучетную систему, как, например, в Контур.Маркете.
1) Подключить систему электронного документооборота или подобрать товароучетный сервис со встроенным ЭДО.

Сверять коды нужно проводить при приемке, чтобы исключить расхождения между данными в системе Честный ЗНАК и на складе. Для этого нужно просканировать коды на товаре и сравнить с теми, что указаны в электронном УПД.
1) Оснастить склад оборудованием для считывания кодов DataMatrix (это могут быть и 2D-сканеры, и ТСД). Если у вас уже есть сканер, его можно проверить на сайте СКБ Контур. Просто отсканируйте код DataMatrix. Если значение будет корректным, страница подтвердит, что сканер подходит для продажи товаров с маркировкой.
2) Поставить программное обеспечение, которое позволит сопоставить коды на товаре и в УПД или проверить свой товароучетный сервис — в нем может быть такая функция.
3) Обучить персонал на складе или на точке с приемкой новому бизнес-процессу и дополнить инструкции.

Понадобится проверять код в системе Честный ЗНАК: принадлежит ли он поставщику, числится ли в обороте, зарегистрирован ли в системе.
1) Оснастить склад оборудованием для считывания кодов DataMatrix (2D-сканеры, ТСД).
2) Поставить программное обеспечение для проверки статуса кодов.

Систему EDI также можно использовать для согласования кодов, до того как коды будут помещены в УПД и переданы в Честный ЗНАК. Это позволит избежать корректировок бухгалтерской первички из-за расхождения в кодах.

1) Связаться с оператором EDI и узнать о возможностях сервиса.